Es uno de los pocos museos al que se puede ingresar gratis, pero previo hay que hacer un tramite para el ingreso. Inicialmente al ingresar por la casona Bustamante se encuentra uno con una pequeña muestra de restos arqueológicos de cerámica y metal de las culturas Chavín, Chimú, Moche, Virú, Recuay, Nasca e Inca, cuenta también con una pinacoteca de cuadros de la escuela Cuzqueña del siglo XVIII. Luego se pasa a la Casona Goyeneche donde esta la sala central numismática, donde se pueden apreciar billetes y monedas que fueron acuñadas en el Banco Central de Reserva de Arequipa en el siglo XVI y XVII; colecciones de monedas de plata de la Colonia acuñadas en Lima, de la República, la colección completa de los billetes de denominaciones Sol de Oro, Intis , Nuevo Sol y Sol actual.
Tambien se muestra la numismática completa del Banco Central de Arequipa, con la colección completa de los billetes emitidos y acuñados por este Banco durante el siglo XVIII, asi como el Characato de Oro de recientemente acuñacion conmemorando el 450 aniversario de la fundación española de esta ciudad.